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现任领导

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刘建国 院长
全面负责合肥物质院工作。分管发展规划、国家安全、重大项目、财务与预算、资产、档案、科学传播。
分管院长办公室、财务处、资产与条件保障处、档案馆、合肥现代科技馆。
周传忠 党委书记
主持合肥物质院党委工作。分管党建、干部、人事人才、离退休、创新文化、群团、统战工作、后勤服务。
分管党委办公室、人事处、服务中心、科学岛学校。
宋云涛 副院长
分管大科学中心、国际科技合作、院地合作和成果转化、知识产权管理体系、园区规划与基建。协调磁约束核聚变、先进核能与核安全业务工作。
分管科学中心与基础设施处、国际合作处、科技促进发展处、科学岛控股公司；联系等离子体所、核能安全所。
屈哲 副院长
分管基础科学研究、研究生教育、科教融合。协调材料科学领域、强磁场科学与技术、医学物理与生物技术领域业务工作。
分管科研规划处、研究生处、文献情报与期刊中心、肿瘤医院；联系固体所、强磁场中心、健康所。
阚瑞峰 副院长
分管高技术研究、质量体系（兼任管理者代表）、计量体系、网络与信息化。协调大气环境光学遥感监测、人工智能与现代农业、战略高技术领域业务工作。
分管高技术与质量处、信息中心、计量与检测中心（实验动物中心）；联系安光所、智能所。
章骏平 纪委书记
主持合肥物质院纪委工作。分管纪检、审计、科研诚信与科技伦理、保密体系、安全体系、环境保护，协管党务、发展规划。
分管监督与审计处、安全保密处。